Médico, filósofo, historiador, lingüista, poeta, escritor, sociólogo, etnólogo, antropólogo y políglota nacido en la Ciudad de El Tocuyo, estado Lara, el 19 de septiembre de 1.858. Estudió en el colegio de Nuestra Señora de la Concordia en su pueblo natal,  obteniendo el grado de bachiller en filosofía en el Colegio Nacional de Trujillo, ingresó en la Universidad de Caracas en 1.878, institución donde obtiene en 1.883 el título de doctor en Ciencias Médicas.

Bajo la influencia de sus maestros Adolfo Ernst y Rafael Villavicencio se impregna de pensamiento científico de la época, representado por Augusto Comte, Carlos Darwin y Herbert Spencer. Conoce en Caracas a Cecilio Acosta y por medio de él, al gran intelectual cubano José Martí.

            En 1.884 inicia su recorrido por el interior del país, una vez graduado de médico. De esta manera Alvarado comienza la construcción de su obra intelectual; para 1.890 viaja a Europa como Cónsul de Venezuela en la ciudad de Southamptom, Inglaterra,  desde donde amplía su visión del pensamiento científico, haciendo amistad y relacionándose con el mundo de la comunidad científica europea.

            El método utilizado para elaborar su gran obra científico social, fue la observación directa de los fenómenos estudiados, lo cual le permitió realizar innumerables trabajos relacionados con el uso medicinal de las plantas a partir del estudio de la medicina indígena, elaborar tratados de mineralogía, realizar la clasificación de plantas así como desarrollar temas de historia utilizando rigurosamente el testimonio escrito para  alejarse de las posiciones subjetivas y especulativas.

            De su obra escrita cabe destacar,  en primer lugar, sus traducciones a la obra del poeta latino Tito Lucrecio Caro de la Naturaleza de las Cosas, así como el Viaje a  las Regiones Equinocciales del Nuevo Continente, de Alejandro de Humboldt y El loro de los Atures de Baudelaire, entre otras. Y de su producción escrita los siguientes libros: Datos Etnográficos de Venezuela, Glosario de Voces Indígenas de Venezuela y el Glosario del Bajo Español en Venezuela.        Como historiador su obra fue prolífica donde vale señalar sus estudios sobre Los Delitos Políticos en la historia de Venezuela, su célebre estudio denominado  Neurosis de los hombres célebres de Venezuela, y la  que es considerada su mejor obra intelectual en el terreno historiográfico, Historia de la Revolución Federal en Venezuela.

            Entre las distinciones obtenidas, resaltan ser Miembro de la Academia Nacional de la Medicina, 1.905. Individuo Número de la Academia de la Lengua Española, 1.922. Miembro de la Academia Nacional de la Historia, 1.923. Miembro de la Sociedad de Antropología y Etnología 1.922 y de la Sociedad Americanista en París.

            Fue condecorado con la Medalla de Instrucción Pública de Francia y Orden Libertador en 1921.  Muere en la ciudad de Valencia,  estado Carabobo,  el 10 de abril de 1929.